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#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>
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4
#include <fcntl.h>
5
#include <unistd.h>
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6
#include <sys/stat.h>
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#include "process_stage.h"
#include "Main_datatypes.h"
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#include "configuration.h"
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#include "../IOcodes/results.h"
11
#include "../malleability/distribution_methods/Distributed_CommDist.h"
12
#include "../malleability/MAM.h"
13

14
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#define DR_MAX_SIZE 1000000000

iker_martin's avatar
iker_martin committed
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int work();
17
double iterate(int async_comm);
18
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double iterate_relaxed(double *time, double *times_stages);
double iterate_rigid(double *time, double *times_stages);
20

21
void init_group_struct(char *argv[], int argc, int myId, int numP);
22
void init_application();
23
void obtain_op_times();
24
void free_application_data();
25
void free_zombie_process();
26

27
void print_general_info(int myId, int grp, int numP);
28
int print_local_results();
29
int print_final_results();
iker_martin's avatar
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30
int create_out_file(char *nombre, int *ptr, int newstdout);
31

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33
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void init_originals();
void init_targets();
35
void update_targets();
36
void user_redistribution(void *args);
37

iker_martin's avatar
iker_martin committed
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39
configuration *config_file;
group_data *group;
40
results_data *results;
41
MPI_Comm comm, new_comm;
42
int run_id = 0; // Utilizado para diferenciar más fácilmente ejecuciones en el análisis
43

44
int main(int argc, char *argv[]) {
45
    int numP, myId, res;
iker_martin's avatar
iker_martin committed
46
    int req;
47
    int im_child;
48
    size_t i;
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50
    MPI_Init_thread(&argc, &argv, MPI_THREAD_MULTIPLE, &req);
iker_martin's avatar
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51
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myId);
52
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numP);
53
    comm = MPI_COMM_WORLD;
54
    new_comm = MPI_COMM_NULL;
iker_martin's avatar
iker_martin committed
55

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57
    if(req != MPI_THREAD_MULTIPLE) {
      printf("No se ha obtenido la configuración de hilos necesaria\nSolicitada %d -- Devuelta %d\n", req, MPI_THREAD_MULTIPLE);
58
59
      fflush(stdout);
      MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, -50);
60
61
    }

62
    init_group_struct(argv, argc, myId, numP);
63
    im_child = MAM_Init(ROOT, &comm, argv[0], user_redistribution, NULL);
64

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    if(im_child) {
      update_targets();
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    } else {
69
      init_application();
70
      init_originals();
71

72
      MPI_Barrier(comm);
73
      results->exec_start = MPI_Wtime();
74
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    }

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    //
    // EMPIEZA LA EJECUCION-------------------------------
    //
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    do {
80
81
      MPI_Comm_size(comm, &(group->numP));
      MPI_Comm_rank(comm, &(group->myId));
82

83
      if(group->grp != 0) {
84
        obtain_op_times(0); //Obtener los nuevos valores de tiempo para el computo
85
        MAM_Retrieve_times(&results->spawn_time[group->grp - 1], &results->sync_time[group->grp - 1], &results->async_time[group->grp - 1], &results->user_time[group->grp - 1], &results->malleability_time[group->grp - 1]);
86
      }
87

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      if(config_file->n_groups != group->grp + 1) { //TODO Llevar a otra funcion
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96
        MAM_Set_configuration(config_file->groups[group->grp+1].sm, MAM_STRAT_SPAWN_CLEAR, 
			config_file->groups[group->grp+1].phy_dist, config_file->groups[group->grp+1].rm, MAM_STRAT_RED_CLEAR);
	for(i=0; i<config_file->groups[group->grp+1].ss_len; i++) {
	  MAM_Set_key_configuration(MAM_SPAWN_STRATEGIES, config_file->groups[group->grp+1].ss[i], &req);
	}
	for(i=0; i<config_file->groups[group->grp+1].rs_len; i++) {
	  MAM_Set_key_configuration(MAM_RED_STRATEGIES, config_file->groups[group->grp+1].rs[i], &req);
	}
97
        MAM_Set_target_number(config_file->groups[group->grp+1].procs); // TODO TO BE DEPRECATED
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99
        if(group->grp != 0) {
100
101
          MAM_Data_modify(&(group->grp), 0, 1, MPI_INT, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_CONSTANT);
          MAM_Data_modify(&(group->iter_start), 0, 1, MPI_INT, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_VARIABLE);
102
        }
103
      }
104
    
105
      res = work();
106

107
      if(res==1) { // Se ha llegado al final de la aplicacion
108
        MPI_Barrier(comm);
109
        results->exec_time = MPI_Wtime() - results->exec_start - results->wasted_time;
110
        print_local_results();
111
      }
112
      
113

114
      reset_results_index(results);
115

116
      group->grp = group->grp + 1;
117
    } while(config_file->n_groups > group->grp);
118

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120
    //
    // TERMINA LA EJECUCION ----------------------------------------------------------
121
    // 
122
    print_final_results(); // Pasado este punto ya no pueden escribir los procesos
123

124
    MPI_Barrier(comm);
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    if(comm != MPI_COMM_WORLD && comm != MPI_COMM_NULL) {
      MPI_Comm_free(&comm);
    }
128
    free_application_data();
129

130
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134
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

/*
135
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141
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143
 * Función de trabajo principal.
 *
 * Incializa los datos para realizar el computo y a continuacion
 * pasa a realizar "maxiter" iteraciones de computo.
 *
 * Terminadas las iteraciones realiza el redimensionado de procesos.
 * Si el redimensionado se realiza de forma asincrona se 
 * siguen realizando iteraciones de computo hasta que termine la 
 * comunicacion asincrona y realizar entonces la sincrona.
144
145
146
147
 *
 * Si el grupo de procesos es el ultimo que va a ejecutar, se devuelve
 * el valor 1 para indicar que no se va a seguir trabajando con nuevos grupos
 * de procesos. En caso contrario se devuelve 0.
148
 */
iker_martin's avatar
iker_martin committed
149
int work() {
150
  int iter, maxiter, state, res;
151
  int wait_completed = MAM_CHECK_COMPLETION;
152

153
  maxiter = config_file->groups[group->grp].iters;
154
  state = MAM_NOT_STARTED;
155
  res = 0;
156

157
  for(iter=group->iter_start; iter < maxiter; iter++) {
158
    iterate(state);
159
  }
160

161
  if(config_file->n_groups != group->grp + 1)
162
    MAM_Checkpoint(&state, wait_completed, user_redistribution, NULL);
163

164
  iter = 0;
165
  while(state == MAM_PENDING || state == MAM_USER_PENDING) {
166
    if(group->grp+1 < config_file->n_groups && iter < config_file->groups[group->grp+1].iters) {
167
      iterate(state);
168
169
      iter++;
      group->iter_start = iter;
170
    } else { wait_completed = MAM_WAIT_COMPLETION; }
171
    MAM_Checkpoint(&state, wait_completed, user_redistribution, NULL);
172
  }
173

174
  //if(state == MAM_COMPLETED) {}
175
  if(config_file->n_groups == group->grp + 1) { res=1; }
176
  return res;
177
178
}

179
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186
187
188

/////////////////////////////////////////
/////////////////////////////////////////
//COMPUTE FUNCTIONS
/////////////////////////////////////////
/////////////////////////////////////////


/*
 * Simula la ejecucción de una iteración de computo en la aplicación
189
190
 * que dura al menos un tiempo determinado por la suma de todas las
 * etapas definidas en la configuracion.
191
 */
192
double iterate(int async_comm) {
193
  double time, *times_stages_aux;
194
  size_t i;
195
196
  double aux = 0;

197
  times_stages_aux = malloc(config_file->n_stages * sizeof(double));
198

199
  if(config_file->rigid_times) {
200
    aux = iterate_rigid(&time, times_stages_aux);
201
  } else {
202
    aux = iterate_relaxed(&time, times_stages_aux);
203
204
  }

205
  // Se esta realizando una redistribucion de datos asincrona
206
  if(async_comm == MAM_PENDING || async_comm == MAM_USER_PENDING) { 
207
    // TODO Que diferencie entre tipo de partes asincronas?
208
    results->iters_async += 1;
209
210
  }

211
  // TODO Pasar el resto de este código a results.c
212
  if(results->iter_index == results->iters_size) { // Aumentar tamaño de ambos vectores de resultados
213
    realloc_results_iters(results, config_file->n_stages, results->iters_size + 100);
214
  }
215
  results->iters_time[results->iter_index] = time;
216
  for(i=0; i < config_file->n_stages; i++) {
217
    results->stage_times[i][results->iter_index] = times_stages_aux[i];
218
  }
219
  results->iter_index = results->iter_index + 1;
220
  // TODO Pasar hasta aqui
221

222
  free(times_stages_aux);
223

224
  return aux;
225
226
}

227
228
229

/*
 * Performs an iteration. The gathered times for iterations
230
 * and stages could be IMPRECISE in order to ensure the 
231
232
233
234
235
 * global execution time is precise.
 */
double iterate_relaxed(double *time, double *times_stages) {
  size_t i;
  double start_time, start_time_stage, aux=0;
236
  start_time = MPI_Wtime(); // Imprecise timings
237
238

  for(i=0; i < config_file->n_stages; i++) {
239
    start_time_stage = MPI_Wtime(); 
240
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260
261
262
    aux+= process_stage(*config_file, config_file->stages[i], *group, comm);
    times_stages[i] = MPI_Wtime() - start_time_stage;
  }

  *time = MPI_Wtime() - start_time; // Guardar tiempos
  return aux;
}

/*
 * Performs an iteration. The gathered times for iterations
 * and stages are ensured to be precise but the global 
 * execution time could be imprecise.
 */
double iterate_rigid(double *time, double *times_stages) {
  size_t i;
  double start_time, start_time_stage, aux=0;

  MPI_Barrier(comm);
  start_time = MPI_Wtime();

  for(i=0; i < config_file->n_stages; i++) {
    start_time_stage = MPI_Wtime();
    aux+= process_stage(*config_file, config_file->stages[i], *group, comm);
263
    MPI_Barrier(comm);
264
265
266
    times_stages[i] = MPI_Wtime() - start_time_stage;
  }

267
  MPI_Barrier(comm);
268
269
270
271
  *time = MPI_Wtime() - start_time; // Guardar tiempos
  return aux;
}

272
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285
286
287
//======================================================||
//======================================================||
//=============INIT/FREE/PRINT FUNCTIONS================||
//======================================================||
//======================================================||

/*
 * Muestra datos generales sobre los procesos, su grupo,
 * en que nodo residen y la version de MPI utilizada.
 */
void print_general_info(int myId, int grp, int numP) {
  int len;
  char *name = malloc(MPI_MAX_PROCESSOR_NAME * sizeof(char));
  char *version = malloc(MPI_MAX_LIBRARY_VERSION_STRING * sizeof(char));
  MPI_Get_processor_name(name, &len);
  MPI_Get_library_version(version, &len);
288
289
  //printf("P%d Nuevo GRUPO %d de %d procs en nodo %s con %s\n", myId, grp, numP, name, version);
  printf("P%d Nuevo GRUPO %d de %d procs en nodo %s -- PID=%d\n", myId, grp, numP, name, getpid());
290
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292
293
294

  free(name);
  free(version);
}

295

296
297
298
/*
 * Pide al proceso raiz imprimir los datos sobre las iteraciones realizadas por el grupo de procesos.
 */
299
300
int print_local_results() {
  int ptr_local, ptr_out, err;
301
302
  char *file_name;

303
304
  // This function causes an overhead in the recorded time for last group
  compute_results_iter(results, group->myId, group->numP, ROOT, config_file->n_stages, config_file->capture_method, comm);
305
  if(group->myId == ROOT) {
306
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    ptr_out = dup(1);

308
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314
315
    file_name = NULL;
    file_name = malloc(40 * sizeof(char));
    if(file_name == NULL) return -1; // No ha sido posible alojar la memoria
    err = snprintf(file_name, 40, "R%d_G%dNP%dID%d.out", run_id, group->grp, group->numP, group->myId);
    if(err < 0) return -2; // No ha sido posible obtener el nombre de fichero
    create_out_file(file_name, &ptr_local, 1);
  
    print_config_group(config_file, group->grp);
316
    print_iter_results(*results);
317
    print_stage_results(*results, config_file->n_stages);
318
319
    free(file_name);

320
    fflush(stdout);
321
322
    close(1);
    dup(ptr_out);
323
    close(ptr_out);
324
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330
331
332
  }
  return 0;
}

/*
 * Si es el ultimo grupo de procesos, pide al proceso raiz mostrar los datos obtenidos de tiempo de ejecucion, creacion de procesos
 * y las comunicaciones.
 */
int print_final_results() {
333
  int ptr_global, err, ptr_out;
334
335
336
337
  char *file_name;

  if(group->myId == ROOT) {

338
    if(config_file->n_groups == group->grp) {
339
340
341
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344
      file_name = NULL;
      file_name = malloc(20 * sizeof(char));
      if(file_name == NULL) return -1; // No ha sido posible alojar la memoria
      err = snprintf(file_name, 20, "R%d_Global.out", run_id);
      if(err < 0) return -2; // No ha sido posible obtener el nombre de fichero

345
      ptr_out = dup(1);
346
      create_out_file(file_name, &ptr_global, 1);
347
348
      print_config(config_file);
      print_global_results(*results, config_file->n_resizes);
349
      fflush(stdout);
350
      free(file_name);
351
352
353

      close(1);
      dup(ptr_out);
354
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360
361
362
    }
  }
  return 0;
}

/*
 * Inicializa la estructura group
 */
void init_group_struct(char *argv[], int argc, int myId, int numP) {
363
  group = malloc(sizeof(group_data));
364
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380
381
  group->myId        = myId;
  group->numP        = numP;
  group->grp         = 0;
  group->iter_start  = 0;
  group->argc        = argc;
  group->argv        = argv;
}

/*
 * Inicializa los datos para este grupo de procesos.
 *
 * En caso de ser el primer grupo de procesos, lee el fichero de configuracion
 * e inicializa los vectores de comunicacion.
 *
 * En caso de ser otro grupo de procesos entra a la funcion "Sons_init()" donde
 * se comunican con los padres para inicializar sus datos.
 */
void init_application() {
382
383
  int i, last_index;

384
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386
387
388
389
390
391
  if(group->argc < 2) {
    printf("Falta el fichero de configuracion. Uso:\n./programa config.ini id\nEl argumento numerico id es opcional\n");
    MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, -1);
  }
  if(group->argc > 2) {
    run_id = atoi(group->argv[2]);
  }

392
  init_config(group->argv[1], &config_file);
393
  results = malloc(sizeof(results_data));
394
  init_results_data(results, config_file->n_resizes, config_file->n_stages, config_file->groups[group->grp].iters);
395
  if(config_file->sdr) {
396
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400
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405
    group->sync_data_groups = config_file->sdr % DR_MAX_SIZE ? config_file->sdr/DR_MAX_SIZE+1 : config_file->sdr/DR_MAX_SIZE;
    group->sync_qty = (int *) malloc(group->sync_data_groups * sizeof(int));
    group->sync_array = (char **) malloc(group->sync_data_groups * sizeof(char *));
    last_index = group->sync_data_groups-1; 
    for(i=0; i<last_index; i++) {
      group->sync_qty[i] = DR_MAX_SIZE;
      malloc_comm_array(&(group->sync_array[i]), group->sync_qty[i], group->myId, group->numP);
    }
    group->sync_qty[last_index] = config_file->sdr % DR_MAX_SIZE ? config_file->sdr % DR_MAX_SIZE : DR_MAX_SIZE;
    malloc_comm_array(&(group->sync_array[last_index]), group->sync_qty[last_index], group->myId, group->numP);
406
  }
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408
  if(config_file->adr) {
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418
    group->async_data_groups = config_file->adr % DR_MAX_SIZE ? config_file->adr/DR_MAX_SIZE+1 : config_file->adr/DR_MAX_SIZE;
    group->async_qty = (int *) malloc(group->async_data_groups * sizeof(int));
    group->async_array = (char **) malloc(group->async_data_groups * sizeof(char *));
    last_index = group->async_data_groups-1; 
    for(i=0; i<last_index; i++) {
      group->async_qty[i] = DR_MAX_SIZE;
      malloc_comm_array(&(group->async_array[i]), group->async_qty[i], group->myId, group->numP);
    }
    group->async_qty[last_index] = config_file->adr % DR_MAX_SIZE ? config_file->adr % DR_MAX_SIZE : DR_MAX_SIZE;
    malloc_comm_array(&(group->async_array[last_index]), group->async_qty[last_index], group->myId, group->numP);
419
  }
420
421

  obtain_op_times(1);
422
423
424
425
}

/*
 * Obtiene cuanto tiempo es necesario para realizar una operacion de PI
426
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428
429
430
431
432
433
 *
 * Si compute esta a 1 se considera que se esta inicializando el entorno
 * y realizará trabajo extra.
 *
 * Si compute esta a 0 se considera un entorno inicializado y solo hay que
 * realizar algunos cambios de reserva de memoria. Si es necesario recalcular
 * algo se obtiene el total de tiempo utilizado en dichas tareas y se resta
 * al tiempo total de ejecucion.
434
 */
435
void obtain_op_times(int compute) {
436
  size_t i;
437
  double time = 0;
438
  for(i=0; i<config_file->n_stages; i++) {
439
    time+=init_stage(config_file, i, *group, comm, compute);
440
  }
441
  if(!compute) {results->wasted_time += time;}
442
443
444
445
446
447
}

/*
 * Libera toda la memoria asociada con la aplicacion
 */
void free_application_data() {
448
  int abort_needed;
449
450
451
452
453
454
455
456
457
  size_t i;

  if(config_file->sdr && group->sync_array != NULL) {
    for(i=0; i<group->sync_data_groups; i++) {
      free(group->sync_array[i]);
      group->sync_array[i] = NULL;
    }
    free(group->sync_qty);
    group->sync_qty = NULL;
458
    free(group->sync_array);
459
460
    group->sync_array = NULL;

461
  }
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465
466
467
468
  if(config_file->adr && group->async_array != NULL) {
    for(i=0; i<group->async_data_groups; i++) {
      free(group->async_array[i]);
      group->async_array[i] = NULL;
    }
    free(group->async_qty);
    group->async_qty = NULL;
469
    free(group->async_array);
470
    group->async_array = NULL;
471
  }
472
  abort_needed = MAM_Finalize();
473
  free_zombie_process();
474
  free(group);
475
  if(abort_needed) { MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, -100); }
476
}
477

478
479
480
481
482

/*
 * Libera la memoria asociada a un proceso Zombie
 */
void free_zombie_process() {
483
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485
  free_results_data(results, config_file->n_stages);
  free(results);

486
  free_config(config_file);
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512
}


/* 
 * Función para crear un fichero con el nombre pasado como argumento.
 * Si el nombre ya existe, se escribe la informacion a continuacion.
 *
 * El proceso que llama a la función pasa a tener como salida estandar
 * dicho fichero si el valor "newstdout" es verdadero.
 *
 */
int create_out_file(char *nombre, int *ptr, int newstdout) {
  int err;

  *ptr = open(nombre, O_WRONLY | O_CREAT | O_APPEND, 0644);
  if(*ptr < 0) return -1; // No ha sido posible crear el fichero

  if(newstdout) {
    err = close(1);
    if(err < 0) return -2; // No es posible modificar la salida estandar
    err = dup(*ptr);
    if(err < 0) return -3; // No es posible modificar la salida estandar
  }

  return 0;
}
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519


//======================================================||
//======================================================||
//================ INIT MALLEABILITY ===================||
//======================================================||
//======================================================||
520
//FIXME TENER EN CUENTA QUE ADR PUEDE SER 0
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524
525

void init_originals() {
  size_t i;

  if(config_file->n_groups > 1) {
526
527
528
    MAM_Data_add(&(group->grp), NULL, 1, MPI_INT, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_CONSTANT);
    MAM_Data_add(&run_id, NULL, 1, MPI_INT, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_CONSTANT);
    MAM_Data_add(&(group->iter_start), NULL, 1, MPI_INT, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_VARIABLE);
529
530
531

    if(config_file->sdr) {
      for(i=0; i<group->sync_data_groups; i++) {
532
        MAM_Data_add(group->sync_array[i], NULL, group->sync_qty[i], MPI_CHAR, MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_VARIABLE);
533
534
535
536
      }
    }
    if(config_file->adr) {
      for(i=0; i<group->async_data_groups; i++) {
537
        MAM_Data_add(group->async_array[i], NULL, group->async_qty[i], MPI_CHAR, MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_CONSTANT);
538
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541
542
543
      }
    }
  }
}

void init_targets() {
544
  size_t i, entries, total_qty;
545
  void *value = NULL;
546
  MPI_Datatype type;
547

548
  MAM_Data_get_pointer(&value, 0, &total_qty, &type, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_CONSTANT);
549
550
551
  group->grp = *((int *)value);
  group->grp = group->grp + 1;

552

553
  recv_config_file(ROOT, new_comm, &config_file);
554
555
556
  results = malloc(sizeof(results_data));
  init_results_data(results, config_file->n_resizes, config_file->n_stages, config_file->groups[group->grp].iters);
  results_comm(results, ROOT, config_file->n_resizes, new_comm);
557

558
  MAM_Data_get_pointer(&value, 1, &total_qty, &type, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_CONSTANT);
559
560
  run_id = *((int *)value);
      
561
  if(config_file->adr) {
562
    MAM_Data_get_entries(MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_CONSTANT, &entries);
563
564
565
    group->async_qty = (int *) malloc(entries * sizeof(int));
    group->async_array = (char **) malloc(entries * sizeof(char *));
    for(i=0; i<entries; i++) {
566
      MAM_Data_get_pointer(&value, i, &total_qty, &type, MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_CONSTANT);
567
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574
575
      group->async_array[i] = (char *)value;
      group->async_qty[i] = DR_MAX_SIZE;
    }
    group->async_qty[entries-1] = config_file->adr % DR_MAX_SIZE ? config_file->adr % DR_MAX_SIZE : DR_MAX_SIZE;
    group->async_data_groups = entries;
  }
}

void update_targets() { //FIXME Should not be needed after redist -- Declarar antes
576
  size_t i, entries, total_qty;
577
  void *value = NULL;
578
  MPI_Datatype type;
579

580
  MAM_Data_get_pointer(&value, 0, &total_qty, &type, MAM_DATA_REPLICATED, MAM_DATA_VARIABLE);
581
582
583
  group->iter_start = *((int *)value);

  if(config_file->sdr) {
584
    MAM_Data_get_entries(MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_VARIABLE, &entries);
585
586
587
    group->sync_qty = (int *) malloc(entries * sizeof(int));
    group->sync_array = (char **) malloc(entries * sizeof(char *));
    for(i=0; i<entries; i++) {
588
      MAM_Data_get_pointer(&value, i, &total_qty, &type, MAM_DATA_DISTRIBUTED, MAM_DATA_VARIABLE);
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593
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595
      group->sync_array[i] = (char *)value;
      group->sync_qty[i] = DR_MAX_SIZE;
    }
    group->sync_qty[entries-1] = config_file->sdr % DR_MAX_SIZE ? config_file->sdr % DR_MAX_SIZE : DR_MAX_SIZE;
    group->sync_data_groups = entries;
  }
}
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599
600
601
602

void user_redistribution(void *args) {
  int commited;
  mam_user_reconf_t user_reconf;

  MAM_Get_Reconf_Info(&user_reconf);
  new_comm = user_reconf.comm;
603
  if(user_reconf.rank_state == MAM_PROC_NEW_RANK) {
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609
    init_targets();
  } else {
    send_config_file(config_file, ROOT, new_comm);
    results_comm(results, ROOT, config_file->n_resizes, new_comm);

    print_local_results();
610
611
612
    if(user_reconf.rank_state == MAM_PROC_ZOMBIE) {
      free_zombie_process();
    }
613
614
  }

615
  MAM_Resume_redistribution(&commited);
616
}